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    基因测序(16S rRNA、ITS)检测

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    咨询量:  
    更新时间:2025-05-11  /
    咨询工程师

    信息概要

    基因测序(16S rRNA、ITS)检测是一种基于高通量测序技术的微生物多样性分析方法,通过检测样本中16S rRNA基因(针对细菌和古菌)及ITS区域(针对真菌)的序列变异,实现对微生物群落的精准鉴定和分类。该检测在环境监测、医学研究、农业生态及工业发酵等领域具有重要应用价值,能够揭示微生物组成、功能及其与环境或宿主的相互作用,为疾病诊断、生态修复及工艺优化提供科学依据。

    检测项目

    • 物种注释与分类学分析
    • Alpha多样性指数计算
    • Beta多样性分析
    • 微生物群落结构解析
    • 核心微生物群鉴定
    • 功能基因预测
    • 差异物种筛选
    • 系统发育树构建
    • 环境因子关联分析
    • 样本间相似性比较
    • 稀有物种检测
    • 病原微生物筛查
    • 抗性基因分析
    • 代谢通路富集分析
    • 共生网络分析
    • 时间序列动态监测
    • 样本污染评估
    • 微生物丰度热图展示
    • 进化距离计算
    • 多组学数据整合分析

    检测范围

    • 土壤微生物群落
    • 水体微生物群落
    • 人体肠道微生物
    • 口腔菌群
    • 皮肤表面微生物
    • 发酵食品微生物
    • 工业废水微生物
    • 空气悬浮微生物
    • 植物内生菌
    • 动物消化道菌群
    • 海洋沉积物微生物
    • 极端环境微生物
    • 医学临床样本
    • 农业土壤病原菌
    • 生物膜微生物
    • 古菌群落分析
    • 真菌孢子多样性
    • 益生菌筛选
    • 抗生素耐药菌监测
    • 病毒共生微生物

    检测方法

    • Illumina NovaSeq高通量测序(双端测序技术,覆盖长片段)
    • PCR扩增(靶向区域特异性引物设计)
    • DNA提取纯化(机械裂解与化学裂解结合)
    • 琼脂糖凝胶电泳(DNA质量可视化验证)
    • Qubit荧光定量(准确定量DNA浓度)
    • 文库构建(接头连接与片段筛选)
    • 生物信息学预处理(原始数据去噪与质控)
    • OTU聚类(97%相似度阈值划分操作分类单元)
    • Silva/UNITE数据库比对(物种注释参考标准库)
    • LEfSe分析(组间差异生物标志物挖掘)
    • PICRUSt功能预测(基于16S数据推断代谢功能)
    • R语言ggplot2可视化(多样性指数图表生成)
    • 机器学习模型(群落与环境因子关联建模)
    • qPCR验证(关键物种绝对定量)
    • 宏基因组数据整合(多组学联合分析)

    检测仪器

    • Illumina NovaSeq 6000
    • Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
    • Qubit 4.0荧光计
    • Nanodrop超微量分光光度计
    • PCR扩增仪
    • Bioanalyzer 2100
    • 离心研磨仪
    • 超低温高速离心机
    • 凝胶成像系统
    • 自动化移液项目合作单位
    • 超纯水制备系统
    • 生物安全柜
    • 恒温混匀仪
    • 电泳仪
    • 高通量DNA提取仪

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